Pembukaan Liga Pendidikan Indonesia (LPI) sukses diselenggarakan pada hari jumat, 1 Februari 2013 bertempat di Stadion Sudirman pukul 14.30 WITA. Acara dibuka oleh Sekretaris Dinas Pemuda Budaya dan Pariwisata (Disporabudpar) Mas'ad Ali. Hadir pula mewakili Dinas Pendidikan (Disdik) Kota Balikpapan Hendrik, S.Pd, Kasdam VI Mulawarman Brigjen TNI Wiyarto S. Sos dan jajarannya serta perwakilan dari KONI Kota Balikpapan, serta Ketua Harian Pengcab PSSI Kota Balikpapan Syarief Syamsil.
Pada hari pembukaan, panitia pelaksana hanya menggelar satu pertandingan saja, yakni pertandingan antara tim SMAN 3 Balikpapan melawan tim SMAN 4 Balikpapan.
LPI Kota Balikpapan tahun 2013 untuk level SLTA diikuti sebanyak 17 tim yang terbagi dalam 4 group, sedangkan untuk level SLTP diikuti sebanyak 27 tim yang terbagi dalam 8 group. Untuk pertandingan level SLTA diselenggarakan di Stadion Sudirman dan untuk pertandingan level SLTP diselenggarakan di Lapangan Sepakbola LPM Sepinggan. Nantinya tim juara dari level SLTA dan level SLTP akan mewakili Kota Balikpapan dalam laga LPI Tingkat Provinsi Kalimantan timur.